Depuis le 1er février 2022, Théo Bongonda est un international congolais. L’attaquant compte 7 sélections pour 2 buts. Ce qui n’était pas gagné d’avance puisque le joueur de 27 ans avait été international belge chez les U19 et U21. L’ancien de Genk a confié qu’il n’a jamais pensé avoir une chance avec les Diables Rouges, alors sous la houlette de Roberto Martinez. « Avec Roberto Martinez, je n'aurais de toute façon jamais été appelé. J'ai marqué 16 buts avec Genk et je ne figurais même pas sur la liste des réservistes » déclare-t-il au Nieuwsblad.
Théo Bongonda ne regrette cependant pas son choix de rejoindre la RD Congo. « Ils m'apprécient beaucoup là-bas. Le mois dernier, j'ai marqué contre le Soudan, ce qui nous a permis de nous qualifier pour la Coupe d'Afrique. Il y avait 100 000 personnes dans le stade - alors que la capacité n'est que de 80 000 places - et ils ont scanné mon nom. J'ai eu la chair de poule ». Le joueur du Spartak Moscou avoue en outre être content de ne jamais avoir été appelé avec la Belgique, « Car il arrive que l'on soit appelé pour la Belgique pendant un certain temps, mais qu'on ne le soit plus jamais, ce qui signifie que l'on ne peut pas jouer pour un autre pays. C'est ce qui est arrivé à Pelé Mboyo, Zakaria Bakkali, Anthony Limbombe. Ils auraient pu jouer pour leur autre pays également »